傳染性軟疣病毒是本病的致病病原,此病毒系痘病毒科的一種脫氧核糖核酸(DNA)病毒,是人體最大的病原性病毒之一,大小約為300微米*200微米*100微米。傳染性軟疣病毒是由一個被一層外膜和一層內膜包裹的雙凹病毒核心組成。病毒基因組鍵。其形態學上與痘瘡、牛痘、羊痘及其他動物病毒相似。學者們最近用DNA限制性內切酶技術已經鑒定出傳染性軟疣病毒的兩個亞型——傳染性軟疣病毒1型與傳染性病毒2型。
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